云南省番茄莴苣褪绿病毒分子检测及遗传进化分析

冯丽肖; 胡荣; 卜姗; 张德咏; 罗香文; 李凡; 丁铭; 张卓; 张松柏; 刘勇; 《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：采集了77份云南省疑似感染莴苣褪绿病毒(lettuce chlorosis virus,LCV)的番茄样本,采用特异性反转录PCR扩增LCV次要外壳蛋白基因(minor coat protein,CPm)近全长序列,常规Sanger测序法测定相应片段序列,并对其进行遗传进化分析.结果 表明,LCV特异性反转录PCR扩增得到与预期大小(1.38 kb)一致的特异性条带;采集的77份番茄样本中LCV检出率为12.99%.测定的LCV CPm;发育分析表明,所有LCV分离物可分为3个亚簇,具有明显的地域特性,其中LCV云南分离物与中国其他地区LCV分离物聚为一亚簇,来自美洲和欧洲分离物分别聚为一个簇.遗传进化分析表明,LCV云南分离物YN58有1个重组事件,序列中嘧啶(C/T)替换率最高(25.25),呈现独立进化、加速扩展趋势.这是在云南省首次报道发现LCV.

关键词： 番茄;莴苣褪绿病毒;分子检测;系统发育分析;进化

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